Les Franciscains établis à Porto au début du 13ème siècle se sont vus assignés ce terrain en 1233 pour la construction d'une église. L'Eglise actuelle construite en 1383, est complétée en 1410, la nouvelle église comprend un agrandissement de l'espace.

La façade principale arbore un vitrail rose, richement décoré. C'est le seul élément de décoration d'origine, la porte de style Baroque s'étend sur 2 étages, sur laquelle une statue de Saint François d'Assise se situe, supporté par des colonnes.